Для обеспечения конфиденциальности в Интернет-банке, PC-банке, Mobile-банке, а также в дополнительных сервисах системы Интернет-банк используется механизм шифрования данных. При взаимодействии
через Интернет осуществляется шифрование и контроль целостности передаваемой информации.
Для проведения клиентами операций по списанию средств со счетов могут использоваться генераторы одноразовых паролей (One Time Password) получаемые посредством СМС из банка, либо генерируемые аппаратными средства – OTP-токены и MAC-токены компании ActivIdentity (смотрите раздел
Технологии аутентификации).
Для криптографической защиты информации в систему Интернет-банк встроены и поставляются в составе системы сразу две взаимно совместимые сертифицированные ФСБ РФ многоплатформенные криптобиблиотеки.
Для разрешения конфликтных ситуаций в системе Интернет-банк ведутся контрольные архивы, в которых хранятся все электронные документы с ЭЦП или АСП. Контрольные архивы хранятся в банке в Сервере БД системы.